MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 22398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021880	ATT	2	6	304603	304608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463037
5002	NC_021880	GCTTTG	2	12	304639	304650	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526463037
5003	NC_021880	T	6	6	304704	304709	0 %	100 %	0 %	0 %	526463037
5004	NC_021880	AT	3	6	304841	304846	50 %	50 %	0 %	0 %	526463037
5005	NC_021880	GAT	2	6	304867	304872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463037
5006	NC_021880	TCT	2	6	304873	304878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463037
5007	NC_021880	TTA	2	6	304967	304972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463037
5008	NC_021880	ACC	2	6	304978	304983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463037
5009	NC_021880	GTG	2	6	304991	304996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463037
5010	NC_021880	ATA	2	6	304997	305002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463037
5011	NC_021880	TGG	2	6	305069	305074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463037
5012	NC_021880	CT	3	6	305077	305082	0 %	50 %	0 %	50 %	526463037
5013	NC_021880	TTG	2	6	305096	305101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463037
5014	NC_021880	GAT	2	6	305110	305115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463037
5015	NC_021880	AAG	2	6	305116	305121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463037
5016	NC_021880	GAG	2	6	305194	305199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463037
5017	NC_021880	TAT	2	6	305200	305205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463037
5018	NC_021880	AGC	2	6	305216	305221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463037
5019	NC_021880	GC	3	6	305377	305382	0 %	0 %	50 %	50 %	526463037
5020	NC_021880	GAT	2	6	307028	307033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463038
5021	NC_021880	AGGCA	2	10	307039	307048	40 %	0 %	40 %	20 %	526463038
5022	NC_021880	TGC	2	6	307063	307068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463038
5023	NC_021880	TGC	2	6	307219	307224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463038
5024	NC_021880	TAT	2	6	307255	307260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463038
5025	NC_021880	TAA	2	6	307303	307308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463038
5026	NC_021880	AGA	2	6	307321	307326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463038
5027	NC_021880	TA	3	6	307352	307357	50 %	50 %	0 %	0 %	526463038
5028	NC_021880	GC	3	6	307405	307410	0 %	0 %	50 %	50 %	526463038
5029	NC_021880	GAG	2	6	307569	307574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463038
5030	NC_021880	ATG	2	6	307625	307630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463038
5031	NC_021880	TGT	2	6	307651	307656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463038
5032	NC_021880	TTG	2	6	307680	307685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463038
5033	NC_021880	AG	3	6	307699	307704	50 %	0 %	50 %	0 %	526463038
5034	NC_021880	ATG	2	6	307802	307807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463038
5035	NC_021880	GGCC	2	8	307818	307825	0 %	0 %	50 %	50 %	526463038
5036	NC_021880	GGA	2	6	307855	307860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463038
5037	NC_021880	TAG	2	6	307917	307922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463038
5038	NC_021880	AAG	2	6	307923	307928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463038
5039	NC_021880	ATT	2	6	307936	307941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463038
5040	NC_021880	TGA	2	6	308006	308011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463569
5041	NC_021880	CCATT	2	10	308163	308172	20 %	40 %	0 %	40 %	526463569
5042	NC_021880	CT	3	6	308194	308199	0 %	50 %	0 %	50 %	526463569
5043	NC_021880	AATG	2	8	308208	308215	50 %	25 %	25 %	0 %	526463569
5044	NC_021880	CTTC	2	8	308232	308239	0 %	50 %	0 %	50 %	526463569
5045	NC_021880	TAT	2	6	308268	308273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463569
5046	NC_021880	AGA	2	6	308275	308280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463569
5047	NC_021880	ATT	2	6	308308	308313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463569
5048	NC_021880	AGG	2	6	308539	308544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463570
5049	NC_021880	AG	3	6	308558	308563	50 %	0 %	50 %	0 %	526463570
5050	NC_021880	AAG	2	6	308667	308672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463570
5051	NC_021880	ACT	2	6	308723	308728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463570
5052	NC_021880	ATCC	2	8	309415	309422	25 %	25 %	0 %	50 %	526463571
5053	NC_021880	AGG	2	6	309490	309495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463571
5054	NC_021880	ACC	2	6	309638	309643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463571
5055	NC_021880	GAG	2	6	309752	309757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463571
5056	NC_021880	TAG	2	6	309779	309784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463571
5057	NC_021880	CAT	2	6	309798	309803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463571
5058	NC_021880	ACC	2	6	309983	309988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463571
5059	NC_021880	ACT	2	6	310013	310018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463571
5060	NC_021880	CTT	2	6	310032	310037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463571
5061	NC_021880	CAT	2	6	310041	310046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463571
5062	NC_021880	GGT	2	6	310067	310072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463571
5063	NC_021880	AGT	2	6	310095	310100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463571
5064	NC_021880	GC	3	6	310234	310239	0 %	0 %	50 %	50 %	526463571
5065	NC_021880	CAA	2	6	310362	310367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463039
5066	NC_021880	TCA	2	6	310391	310396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463039
5067	NC_021880	TTCT	2	8	310398	310405	0 %	75 %	0 %	25 %	526463039
5068	NC_021880	CTC	2	6	310411	310416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463039
5069	NC_021880	CCTA	2	8	310459	310466	25 %	25 %	0 %	50 %	526463039
5070	NC_021880	ATC	2	6	310492	310497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463039
5071	NC_021880	TGCT	2	8	310567	310574	0 %	50 %	25 %	25 %	526463039
5072	NC_021880	GCA	2	6	310619	310624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463039
5073	NC_021880	AAT	2	6	310628	310633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463039
5074	NC_021880	AAT	2	6	310796	310801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463039
5075	NC_021880	GAG	2	6	310834	310839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463039
5076	NC_021880	TAG	2	6	310887	310892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463039
5077	NC_021880	TCA	2	6	310916	310921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463039
5078	NC_021880	TC	3	6	310975	310980	0 %	50 %	0 %	50 %	526463039
5079	NC_021880	GGAG	2	8	311042	311049	25 %	0 %	75 %	0 %	526463039
5080	NC_021880	GCA	2	6	311081	311086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463039
5081	NC_021880	CAT	2	6	311179	311184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463039
5082	NC_021880	TA	3	6	311769	311774	50 %	50 %	0 %	0 %	526463040
5083	NC_021880	TGA	2	6	311806	311811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463040
5084	NC_021880	TATT	2	8	311852	311859	25 %	75 %	0 %	0 %	526463040
5085	NC_021880	GAAG	2	8	311863	311870	50 %	0 %	50 %	0 %	526463040
5086	NC_021880	CAG	2	6	311876	311881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463040
5087	NC_021880	GAT	2	6	311912	311917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463040
5088	NC_021880	TGG	2	6	311992	311997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463040
5089	NC_021880	TAG	2	6	312001	312006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463040
5090	NC_021880	AGA	2	6	312040	312045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463040
5091	NC_021880	GTG	3	9	312099	312107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463040
5092	NC_021880	TTG	2	6	312192	312197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463040
5093	NC_021880	CGT	2	6	312239	312244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463040
5094	NC_021880	TG	3	6	312268	312273	0 %	50 %	50 %	0 %	526463040
5095	NC_021880	TCA	2	6	312349	312354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463040
5096	NC_021880	GT	3	6	312357	312362	0 %	50 %	50 %	0 %	526463040
5097	NC_021880	TGT	3	9	312360	312368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463040
5098	NC_021880	TGA	2	6	312370	312375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463040
5099	NC_021880	GAC	2	6	312481	312486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463040
5100	NC_021880	TA	3	6	312509	312514	50 %	50 %	0 %	0 %	526463040
5101	NC_021880	TAC	2	6	312610	312615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463040
5102	NC_021880	GT	3	6	312650	312655	0 %	50 %	50 %	0 %	526463040
5103	NC_021880	TGTGG	2	10	312690	312699	0 %	40 %	60 %	0 %	526463040
5104	NC_021880	GTA	2	6	312813	312818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463040
5105	NC_021880	TGC	2	6	312883	312888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463040
5106	NC_021880	AAG	2	6	312902	312907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463040
5107	NC_021880	TATC	2	8	313047	313054	25 %	50 %	0 %	25 %	526463040
5108	NC_021880	GTTC	2	8	313125	313132	0 %	50 %	25 %	25 %	526463040
5109	NC_021880	GAT	3	9	313181	313189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463040
5110	NC_021880	GTC	2	6	313198	313203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463040
5111	NC_021880	GCA	2	6	313228	313233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463040
5112	NC_021880	AT	4	8	313330	313337	50 %	50 %	0 %	0 %	526463040
5113	NC_021880	CAGT	2	8	313346	313353	25 %	25 %	25 %	25 %	526463040
5114	NC_021880	TTCC	2	8	313361	313368	0 %	50 %	0 %	50 %	526463040
5115	NC_021880	GAA	2	6	313417	313422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463040
5116	NC_021880	TAT	2	6	313439	313444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463040
5117	NC_021880	GGT	2	6	313507	313512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463040
5118	NC_021880	AGC	2	6	313521	313526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463040
5119	NC_021880	GA	3	6	313710	313715	50 %	0 %	50 %	0 %	526463041
5120	NC_021880	CCTA	2	8	313740	313747	25 %	25 %	0 %	50 %	526463041
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5122	NC_021880	TGT	2	6	313841	313846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463041
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5231	NC_021880	CATT	2	8	323293	323300	25 %	50 %	0 %	25 %	526463044
5232	NC_021880	AG	3	6	323309	323314	50 %	0 %	50 %	0 %	526463044
5233	NC_021880	GAATG	2	10	323335	323344	40 %	20 %	40 %	0 %	526463044
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5241	NC_021880	ATA	3	9	323889	323897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463044
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5364	NC_021880	ATG	2	6	330082	330087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463049
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